Історія ЗОШ №6 починається ще з1877 року, коли на місці теперішньої школи  було побудоване одноповерхове приміщення в якому жив начальник станції Бірзула. Але в зв'язку з посиленим рухом поїздів, збільшилась кількість обслуговуючого персоналу на транспорті. Населення маленької станції стрімко зростало. У зв'язку з цим виникла необхідність відкриття школи для навчання дітей службовців залізничного транспорту. У 1882 році керівництво залізничної дороги передало під школу дім начальника станції. Це була перша школа в Бірзулі. В ній було 5 класів. Перший, другий, третій -   називалися групами, а четвертий і п'ятий - класами. Ось чому вона отримала назву «Вьісшее начальное двухклассное железнодорожное училище Юго-Западной железной дороги».

Навчалися в цій школі лише діти заможних батьків, діти бідних - одержати освіту тут не могли. З 1890 році хлопці-випускники цього училища стали вступати до Одеського технічного училища після закінчення якого отримували професію машиністів паровозів. Заняття в школі проводилися в одну зміну. В класах було від 25 до 28 учнів, а всього в школі навчалось 120-150 учнів.

Бірзула, на той час, була маленьким селищем. За школою було розташовано 6 будинків, і лише в 1900 році почали будувати будинки за бульварним селищем.

Після 1900 року в школі добудували другий поверх та залу. Біля школи був розташований сад від пришкільного будинку до мосту. Для приїжджих учнів існував інтернат в якому мешкало 50 учнів. Перед школою була дерев'яна будівля, в якій розміщувались залізничні майстерні.

З 1917 року в школі почали вчитися діти робітників і службовців, тоді майстерні перейшли до школи.

У 1923 році при школі була створена дитяча організація «юних спартаківців», яка з 1924 року стала носити ім'я В.І. Леніна, а її члени називалися піонерами. В ці ж роки була створена і комсомольська організація.

З 1924 року школа стала семерічною та робітничою. Були введені уроки праці,

по 2 години на тиждень. Діти працювали в столярній і слюсарній майстернях.

Ще одна пам'ятна подія відбулася в літку 1924 року. В приміщенні школи І з'їзд народних депутатів Молдавії проголосив Молдавську Автономну Радянську Соціалістичну Республіку зі столицею в місті Балта. В президії з'їзду народних депутатів був присутній Г.І. Котовський - відомий революційний діяч.

В 1932 році школа стала середньою. За часи Радянської влади при школі були створені фізичний, біологічний та хімічний кабінети. Перед Великою Вітчизняною війною в школі вже навчалось близько 500 учнів.

У 1932 році у зв'язку із приїздом відомого партійного діяча А.Н. Скрипника за пропозицією вчителя Сопильнюк Є С. школу було перейменовано на його честь. Вона носила ім'я А.Н. Скрипника до 1934 року, коли отримала ім'я В. Чкалова.

З 1936 року школа вважалася базовою. Викладацький склад був дуже сильним. До школи, з метою перейняття досвіду, приходило багато вчителів з інших шкіл.

В роки Великої Вітчизняної війни школа значно постраждала, все її майно було вивезено фашистами, а майстерні зруйновано. У післявоєнні роки почали відновлюватись кабінети, побудована слюсарно-механічна майстерня, теплиця, школа мала учбово-дослідну ділянку.

За часи існування школи її директорами були:

1932 - 1937 - Родзиєвський І.П. (вчитель математики і фізики, у 1937 році заарештований та у листопаді розстріляний в Тирасполі).

1937 - 1941 - Гертберг Анатолій Маркович

1941 - 1945 - Ястремський Іван Іванович

1945 - 1951 - Здаврадинський Михайло Іванович

1951 - 1962 - Слюсаренко Олександр Федорович

1962 - 1965 - Супрун Георгій Давидович

1965 - 1971 - Супрун Віра Антонівна

1971 - 1983 - Логінов Олександр Володимирович

1983 - 1985 - Харьковський Анатолій Родіонович

1985 - 1986 - Лаврентьєва Нінель Дмитрівна

1986 - 1987 - Блінова Валентина Петрівна

1987 - 2021 - Ковтуняк Віктор Федорович

2021 - по сьогоднішній день директором школи №6 є Тимчик Оксана Петрівна

В школі працювали такі знамениті педагоги

Заслужені вчителі УРСР:

1.     Діордієв Петро Гнатович (вчитель математики)

2.     Супрун Віра Анатоліївна (вчитель української мови, директор)

Орденом Леніна і орденом Трудового Червоного Прапора були нагороджені:

1.     Діордієв Петро Гнатович (вчитель математики)

2.     Діордієва Олена Петрівна (вчитель фізики)

3.     Колянківська Ольга Прохорівна (вчитель біології)

4.     Матковська Наталя Іванівна (вчитель української мови і літератури)

Орденом Трудового Червоного Прапора:

1.          Янковська Валентина Антонівна

2.          Здаврадинський Міхаїл Іванович

3.          Формальський Йоган Ісакович

4.          Слюсаренко Олександр Федорович

Орденом Леніна:

     Крутов Іван Володимирович - завуч, математик.

     Навчався і виховувався в нашій школі Кирило Васильович   Бочкович, Герой Радянського Союзу який загинув смертю хоробрих у Великий Вітчизняній війні

відстоюючи честь, свободу і незалежність нашої Батьківщини. У його честь у 1960 році була названа піонерська дружина школи.

      Прикладом для учнів стало життя ще таких відомих випускників школи:

Москалюк Геннадій Петрович – воїн - інтернаціоналіст  загинувший  у 1988 р. під час бойових дій в Афганістані;

     Віталій Козак – залізничник, який загинув під час виконання громадського обов’язку. Його іменем названа вулиця в нашому місті.

     Кожеко Віктор, який загинув під час операції затримання кілерів у ніч на 30 вересня 2011р. біля с.Кошари Комінтернівського району на Одещині.

     В останні роки в школі працює 38 вчителів. З них:

-         вчителі вищої категорії – 9

-         вчителі із званням «Старший вчитель» - 4

-         вчителі І категорії -13

-         вчителі ІІ категорії – 6

-         молоді вчителі спеціалісти – 9. Вони призначені на роботу в школу за останні два роки.

Вчителі гордяться учнями, які закінчили школу з золотими та срібними медалями:

-         2007р.  Денисюк Олена – золота медаль

-         2008р.  Кравчук Євген – золота медаль,

                   Олексійчук Марина – золота медаль

                   Вітвицька Ірина – срібна медаль

-         2009р.  Гареник Анастасія – золота медаль

-         2010р.  Добра Тетяна – золота медаль

             Мазурик Наталя – золота медаль

             Мазур Тетяна – срібна медаль

             Мазуренко Ольга- срібна медаль

-         2011р.  Каталіченко Наталія – золота медаль

-         2012р. Ісадченко Юлія – золота медаль

             Тоток Олександр – золота медаль

       Приємно, коли учні школи досягають вершин. За всю історію існування школи можна було б перелічити велику кількість учнів, які засяяли на небесному небосхилі ясними зірочками. Серед них такі, як:

-         Ковальчук Олександр Леонідович - м.Київ, австрійське посольство, перекладач

-         Великий Юрій Юрійович – м. Київ, студія «Квартал 95», авторська група, актор «Брати шумахери»

-         Яровий Сергій Анатолійович - ветеран військової служби, полковник запасу Голова Котовського міського осередку Міжнародної Асоціації «КОЗАЦТВО»,Отаман козацького товариства, командир Котовського козацького полку             імені Великого Князя Ярослава Мудрого.

-         Ксензицька Олена Володимирівна – інспектор відділу освіти м. Котовська.

-         Суминова Людмила Павлівна – колишній директор Новоукраїнського цукрового заводу.

-         Моспан - Бєлогорлова Валентина Харитонівна – вчитель біології м. Одеси

-         Кузніцова Світлана Геннадіївна – працівник служби «Сім’ї та молоді»

-         Книжник Олена Володимирівна – вчитель української мови та літератури школи №6 м. Котовська

-         Тимчик Оксана Петрівна – директор школи №6 м. Подільськ